Морские дьяволы. Особое задание — это продолжение популярного остросюжетного сериала «Морские дьяволы» с героями предыдущих сезонов, отрядом специального назначения «Нерпы». В новом сезоне отряд специального назначения «Нерпы» направляют в Калининград на засекреченную военную базу, где случилась авиакатастрофа, унесшая жизни нескольких бойцов местного регионального спецназа. Следственный комитет совместно с ФСБ пытаются выяснить причину произошедшего. «Нерпам» предстоит взять на себя обязанности погибших бойцов и действовать по возможности автономно, чтобы пресечь возможность вмешательства враждебных сил и сохранить в тайне собственное присутствие.